OSX Lionをクリーンインストール後TimeMachineで復元、homebrewの権限がおかしくなる

http://d.hatena.ne.jp/aoe-tk/20110423/1303565256
こちらに詳しく書いてある通り、homebrewは/usr/local 以下の所有者を変えるわけですが、
OSのクリーンインストール→TimeMachineで復元 後には、所有者がroot:wheelに戻ってしまいます。
なので、brew updateとかするとpermission deniedでエラー。

sudo chown -R $USER /usr/local
で直ったけど、なんか間違ってるよな、これ。